研究报告

龙眼Dlc4h基因组织特异性表达及其生物信息学分析  

张秋颖1 , 郑威1,2* , 董学明1 , 于雪飞3 , 陈宁1* , 任禾群2
1哈尔滨商业大学,药物工程技术研究中心,哈尔滨, 150076; 2哈尔滨商业大学药学院,哈尔滨,150076; 3哈尔滨商业大学图书馆,哈尔滨,150028
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 9 篇   
收稿日期: 2019年02月02日    接受日期: 2019年02月08日    发表日期: 2020年06月17日
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摘要

肉桂酸 4- 羟化酶(cinnamate-4-hydroxylase, c4h)是合成黄酮类化合物的关键酶之一。为了研究Dlc4h基因的结构及其在龙眼次级代谢产物合成中的功能,本研究采用实时荧光定量 PCR (qRT-PCR)技术分析Dlc4h基因在龙眼根、茎、叶组织中的特异性表达,并对该基因进行了生物信息学分析。定量分析结果表明:Dlc4h基因在各组织中均有表达,表达量由高到低依次为根、茎、叶。生物信息学分析结果表明:该基因全长1 611 bp,编码 536个氨基酸;蛋白质相对分子质量为 61 389.45 Da,等电点(pI)8.82;它是一种不含信号肽、有跨膜结构、定位于质膜的可溶性亲水蛋白;二级结构主要包括α- 螺旋和无规则卷曲,并具有卷曲螺旋结构;采用 SWISS-MODEL构建Dlc4h三级结构模型,运用 Ramachandran评估表明该模型准确可靠;Dlc4h预测得到的配体结合位点分别为 128Arg145Val146Phe153Trp157Arg213Met329Ile332Ala333Ala336Thr337Thr340Ser402His467Pro468Phe473Arg475Cys476Pro。本研究的结果为进一步研究Dlc4h基因在龙眼黄酮类化合物生物合成途径中行使的功能提供依据。
 

关键词
龙眼(Dimocarpus longan Lour.);肉桂酸 4- 羟化酶;生物信息学分析

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《分子植物育种》印刷版
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